第二代和第三代流感疫苗的主要区别在于疫苗中所含的病毒株和疫苗的制备方法。以下是第二代和第三代流感疫苗的主要区别，供参考：

1. 病毒株

第二代流感疫苗通常包括两种流感病毒株，一种是甲型流感病毒(通常是H1N1亚型),另一种是乙型流感病毒(分为两行类型，通常是B/Victoria或B/Yamagata亚型)。

三代流感疫苗包括四种流感病毒株，包括两种甲型流感病毒(H1N1和H3N2亚型)和两种乙型流感病毒(B/Victoria和B/Yamagata亚型)。

2. 制备方法

第二代流感疫苗通常采用传统的鸡蛋培养和制备方法，即将流感病毒接种到鸡蛋中进行培养和繁殖，然后收集病毒并制备疫苗。第三代流感疫苗采用更先进的细胞培养和制备方法，即利用细胞培养系统生产病毒和疫苗，避免了传统制备方法中的一些限制和潜在问题。